Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
APRG1Q8IVJ8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms