Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms