Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms