Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms