Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms