Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms