Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PDLIM3Q53GG5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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