Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN3Q16667 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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