Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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