Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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