Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3GAP1Q15042 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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