Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms