Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms