Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
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