Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCN1BQ07699 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms