Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX1P78337 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX1P78337 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX1P78337 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX1P78337 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX1P78337 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX1P78337 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX1P78337 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX1P78337 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX1P78337 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX1P78337 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX1P78337 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX1P78337 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX1P78337 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms