Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NME5P56597 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NME5P56597 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NME5P56597 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NME5P56597 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NME5P56597 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NME5P56597 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME5P56597 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME5P56597 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms