Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAD23AP54725 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms