Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THOP1P52888 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms