Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms