Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC27P30260 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC27P30260 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC27P30260 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC27P30260 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC27P30260 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC27P30260 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC27P30260 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC27P30260 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC27P30260 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC27P30260 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC27P30260 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC27P30260 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC27P30260 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC27P30260 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC27P30260 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms