Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCAP28676 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCAP28676 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms