Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PLNP26678 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PLNP26678 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PLNP26678 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms