Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms