Protein–RNA interactions for Protein: P22735

TGM1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM1P22735 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM1P22735 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM1P22735 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM1P22735 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM1P22735 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM1P22735 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM1P22735 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM1P22735 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM1P22735 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM1P22735 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM1P22735 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms