Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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