Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB1P16220 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB1P16220 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms