Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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