Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JRKO75564 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JRKO75564 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JRKO75564 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JRKO75564 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
JRKO75564 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
JRKO75564 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
JRKO75564 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
JRKO75564 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
JRKO75564 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
JRKO75564 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms