Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms