Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPED1A4D0V7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms