Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT52Q9Y366 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFT52Q9Y366 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms