Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms