Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms