Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms