Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms