Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms