Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms