Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms