Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms