Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms