Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2Q9BX26 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms