Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTDSS2Q9BVG9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms