Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTA3Q9BTC8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms