Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC22A12Q96S37 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms