Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms