Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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