Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BICD1Q96G01 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms