Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms