Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms